Доброе время суток! Предлагаю вам посмотреть прохождение малоизвестного квеста "Утечка", предлагаемого в Институте. При его прохождение выяснилось, что попасть в штаб Подземки можно альтернативным общеизвестному путём. Это также отражено. https://www.nexusmods.com/fallout4/mods/14546 - люк в штаб Подземки