Малая тыквенная муха Dacus ciliatus повреждает плоды семейства Тыквенных: арбуз обыкновенный, дыни, кабачки, огурец обыкновенный, тыкву крупноплодную. Реже другие культурные и дикие растения этого семейства: огурец ворсянковый, многоплодный и другие. Также личинки тыквенной мухи повреждают апельсин и иногда томат.